本科室应用二代测序技术精准诊断维持性血液

文章来源:结核性脑膜炎   发布时间:2020-10-10 17:53:26   点击数:
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详见:中国血液净化,,19(06):-.

背景:结核分枝杆菌感染作为一种传染病,现位居传染病死因的首位。中国作为结核高发国家,特别是终末期肾病患者接受透析或肾移植治疗,免疫力通常较正常人低下,当合并中枢神经系统感染症状时,应考虑到结核引起的脑膜炎。近年来,随着生物实验技术的快速发展,二代测序技术作为一种新型的临床诊疗手段,有着高通量、低成本的优势,在临床医学中广泛应用。目前国内使用二代测序技术确诊病例仍不多见,本文回顾使用二代测序(NGS)技术对1例疑似结核性脑膜炎的尿毒症患者脑脊液进行检测并明确诊断,同时进行文献复习,探讨NGS技术在中枢神经系统感染性疾病诊断中的价值。

病例:本科室应用二代测序技术精准诊断了1例规律血液透析患者伴发结核性脑膜炎,该患者出现不明原因的出现发热,抽搐、口吐白沫及其他神经系统症状,患者既往有“高血压、2型糖尿病、痛风、系统性红斑狼疮”病史。入院4个月前于我科住院,结核不能排除,予抗结核治疗,患者未定期随诊,入院3个月前自行停用抗结核药。入院后常规病原学检查结果阴性,结合病史,经验性的早期、适量、五联抗结核治疗后,脑脊液NGS仍检测到结核分枝杆菌的基因序列。

文献复习:本文检索了近20年国内学者发表的使用二代测序辅助诊断中枢神经系统感染相关的中英文文章,经筛选保留了31篇,检索到的文献中采用脑脊液NGS检测到的病原体分类、数量、检出率、预后和来源见图。文献综合显示脑脊液NGS检测的优势如下:

(1)NGS在疾病的病程中基本均可以检出病原体,早期诊断有助于精准治疗改善预后;(2)和传统病原学检测方法相比,NGS的检测阳性率提高;

(3)随着检测时间的延迟,检测阳性率随之下降。这种现象归因于抗病毒治疗或宿主防御反应后病毒DNA的降解,建议在中枢神经系统病毒感染早期或抗病毒治疗前,对脑脊液病毒DNA进行测序;

(4)NGS在未知病原体的检出比传统检测方法有优势,且NGS技术大大缩短了诊断时间;

(5)对于病原学检测阴性尤其是使用抗感染药物之后采集的临床标本,NGS可以早期快速检测病原体,早期辅助诊断,减少药物副反应、降低死亡率。

结论:基因二代测序因有着高通量、低成本的优势,为中枢神经系统感染等临床诊疗提供了一个新手段。NGS技术有望成为难治性中枢神经系统感染一线诊断方法,缩短确诊时间,提高治愈率。未来是否能够通过检测病原体基因序列的动态变化,从而反应治疗效果或疾病进展,值得期待。

编辑

李畅/徐玮

医院(南京医院)肾内科

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